A conservação dos ambientes aquáticos implica em manter suas condições naturais, para que possam ter seus múltiplos usos garantidos. As pesquisas possibilitam o conhecimento da estrutura e o funcionamento desses ecossistemas, seja ele lêntico (águas paradas como lagos e represas) ou lótico (de águas correntes) viabilizando, portanto o seu manejo e a maximização da sua produtividade (ESTEVES, 1998).

A qualidade da água é determinada em função do seu uso previsto e pode ser representada por meio de diversos parâmetros que traduzem as suas características físicas, químicas e biológicas. Os problemas relacionados à qualidade da água podem afetar diretamente os seus usos, gerando sérios problemas à saúde pública, ao ambiente e à economia.